Agata Czekalińska jest doktorem sztuk muzycznych w dyscyplinie artystycznej dyrygentura chóralna. Od roku 2021 pełni funkcję dziekana Wydziału Edukacji Muzycznej Akademii Sztuki w Szczecinie.

W roku 2006 ukończyła Akademię Muzyczną w Poznaniu Filia w Szczecinie na specjalności dyrygentura chóralna oraz Podyplomowe Studium Emisji Głosu oraz Podyplomowe Studium Chórmistrzowskie w Akademii Muzycznej w Bydgoszczy. 2006 roku zatrudniona w szczecińskiej Filii Akademii Muzycznej w Poznaniu, gdzie prowadziła zajęcia z dyrygowania, czytania partytur, zespołów dla praktyk studenckich i wiele innych. Od momentu powstania Akademii Sztuki prowadzi zajęcia z dyrygentury, czytania partytur oraz chór wydziałowy z którym przygotowuje wielkie formy wokalno-instrumentalne.
Od roku 2007 jest dyrygentem Chóru Dziecięcego Voci Veloci Państwowej Szkoły Muzycznej I stopnia w Szczecinie, wraz z którym koncertuje zarówno w Polsce, jak i poza jej granicami. Chór wielokrotnie brał udział w festiwalach i konkursach chóralnych zdobywając na nich najwyższe laury m.in.: Nagroda specjalna dla najlepszego zespołu na Międzynarodowym Konkursie Muzycznym Malchower Kirchenpreis, Niemcy, 2015. Złote pasmo (Zwycięzca Kategorii) w Kategorii Muzyki Współczesnej oraz srebrne pasmo w kategorii chórów dziecięcych do 16 roku życia podczas International Festival of Advent and Christmas Music Bratislava, Słowacja 2015. Srebrny Dyplom na Międzynarodowym Festiwalu Chóralnym im Feliksa Nowowiejskiego w Barczewie, 2015, srebrny dyplom na Międzynarodowym Festiwalu Pieśni Chóralnej w Międzyzdrojach w kategorii „Musica sacra”, 2016. Złoty Dyplom podczas Bałtyckiego Konkursu Chórów Pomerania Cantat w Filharmonii Koszalińskiej, 2019. Złoty Dyplom oraz Nagroda specjalna za najlepsze wykonanie utworu sakralnego podczas Ogólnopolskiego Konkursu Chórów Filii Melodis w Połczynie Zdroju, Srebrny Dyplom w kategorii Chórów Dziecięcych do lat 16Srebrny Dyplom w kategorii Muzyki Współczesnej podczas International Festival of Advent and Christmas Music Bratislava, Słowacja, 2019. Złoty Dyplom i nominacja do koncertu galowego Talent Roku podczas Wojewódzki Przeglądu Chórów i Zespołów Kameralnych. Szczecin Zamek Książąt Pomorskich, Srebrny Dyplom podczas International Choral Competition Christmas Inside – Rzym, Włochy 2021.
Prowadzi również Szczeciński Chór Pielęgniarek i Położnych wraz z którym koncertowała zarówno w Polsce jak i za granicą, zdobywając nagrody na polskich i zagranicznych festiwalach. Nagrała również płytę zawierającą najpiękniejsze polskie kolędy w opracowaniu na chór żeński.